J'ai un ensemble de données composé d'éléments de trois groupes, appelons-les G1, G2 et G3. J'ai analysé certaines caractéristiques de ces éléments et les ai divisés en 3 types de "comportement" T1, T2 et T3 (j'ai utilisé l'analyse en grappes pour cela). Donc, maintenant j'ai une table de...
Supposons que nous ayons l'ensemble de données suivant: Men Women Dieting 10 30 Non-dieting 5 60 Si je lance le test exact de Fisher dans R, qu'est-ce que cela alternative = greaterimplique (ou moins)? Par exemple: mat = matrix(c(10,5,30,60), 2,2) fisher.test(mat, alternative="greater") Je reçois...
Le mgcvpackage pour Ra deux fonctions pour ajuster les interactions des produits tensoriels: te()et ti(). Je comprends la division de base du travail entre les deux (ajustement d'une interaction non linéaire vs décomposition de cette interaction en effets principaux et interaction). Ce que je ne...
Les degrés de liberté dans ma table F ne montent pas assez haut pour mon gros échantillon. Par exemple, si j'ai un F avec 5 et 6744 degrés de liberté, comment puis-je trouver la valeur critique de 5% pour une ANOVA? Et si je faisais un test du chi carré avec de grands degrés de liberté? [Une...
Dans mon travail, j'ai vu plusieurs utilisations du test exact de Fisher, et je me demandais dans quelle mesure il correspond à mes données. En regardant plusieurs sources, j'ai compris comment calculer la statistique, mais je n'ai jamais vu d'explication claire et formelle de l'hypothèse nulle...
Contexte biologique Au fil du temps, certaines espèces végétales ont tendance à dupliquer leurs génomes entiers, obtenant une copie supplémentaire de chaque gène. En raison de l'instabilité de cette configuration, bon nombre de ces gènes sont ensuite supprimés, et le génome se réorganise et se...
Il s'agit d'une mosaïque de l'ensemble de données de table de contingence HairEyeColordécrite ici . Comment interpréter les couleurs représentant les résidus? Quelle est la différence entre les résidus de Pearson élevés et positifs (indiqués en bleu) par rapport aux résidus faibles et négatifs...
J'analyse une table 2x2 à partir d'un petit ensemble de données de 30 patients. Nous essayons rétrospectivement de trouver des variables qui donnent un indice sur le traitement à choisir. Les variables (obs normal / étrange) et la décision de traitement (A / B) sont d'un intérêt particulier et donc...
Pour un 2 × 22×22 \times 2 table, deux façons de faire l'inférence sur la table est à travers le test exact de Fisher et aussi une régression logistique. On m'a dit qu'en utilisant un test exact de Fisher, nous ne sommes intéressés que par la présence d'association. Mais qu'avec une régression...
Je compare deux groupes de mutants dont chacun ne peut avoir qu'un phénotype différent sur 21. J'aimerais voir si la distribution de ces résultats est similaire entre deux groupes. J'ai trouvé un test en ligne qui calcule le " test du chi carré pour l'égalité des distributions" et me donne des...
J'ai un GLMM du formulaire: lmer(present? ~ factor1 + factor2 + continuous + factor1*continuous + (1 | factor3), family=binomial) Lorsque j'utilise drop1(model, test="Chi"), j'obtiens des résultats différents de ceux que j'utilise à Anova(model, type="III")partir du package de voiture ou...
Ce qui suit est une question sur les nombreuses visualisations offertes comme «preuve par l'image» de l'existence du paradoxe de Simpson, et peut-être une question sur la terminologie. Le Paradoxe de Simpson est un phénomène assez simple à décrire et à donner des exemples numériques (la raison pour...
J'essaie de comprendre l'utilisation de la régression logistique dans les tables de contingence 2x2 et Ix2. Par exemple, en utilisant cela comme exemple Quelle est la différence entre l'utilisation du test du chi carré et l'utilisation de la régression logistique? Qu'en est-il d'une table avec...
Je teste l'indépendance dans une table de contingenceJe ne sais pas si le test G ou le test chi carré de Pearson est meilleur. La taille de l'échantillon est de l'ordre de centaines, mais le nombre de cellules est faible. Comme indiqué sur la page Wikipedia , l'approximation de la distribution du...
Je teste l'indépendance de deux variables, A et B, stratifiées par C. A et B sont des variables binaires et C est catégorique (5 valeurs). En exécutant le test exact de Fisher pour A et B (toutes strates combinées), j'obtiens: ## (B) ## (A) FALSE TRUE ## FALSE 1841 85 ## TRUE 915 74 OR: 1.75 (1.25...
Compte tenu de cas de cancer du poumon et de témoins appariés (sans cancer du poumon) (appariement basé sur l'âge, le sexe, etc.). Pour essayer de trouver des preuves entre l'effet du tabagisme sur le cancer du poumon, j'ai utilisé le test exact de Fisher sur le tableau de contingence. Cependant,...
Je travaille à travers les exemples de Doing Bayesian Data Analysis de Kruschke , en particulier l'ANOVA exponentielle de Poisson en ch. 22, qu'il présente comme une alternative aux tests d'indépendance du chi carré fréquentiste pour les tables de contingence. Je peux voir comment nous obtenons des...
J'ai un ensemble de données avec deux variables nominales catégorielles (les deux avec 5 catégories). Je voudrais savoir si (et comment) je suis capable d'identifier des corrélations potentielles entre les catégories de ces deux variables. En d'autres termes, si par exemple les résultats de la...
Nous préparons un manuscrit et l'éditeur nous a demandé de convertir une figure avec un boxplot en tableau "à cause du contenu des données plus exact". Bien que je pense que les boxplots sont assez décents pour révéler quelque chose sur les données, je me demandais ce que vous en pensez? Optez-vous...
Mon projet actuel peut m'obliger à construire un modèle pour prédire le comportement d'un certain groupe de personnes. l'ensemble de données de formation ne contient que 6 variables (id est uniquement à des fins d'identification): id, age, income, gender, job category, monthly spend dans laquelle...