Vous avez besoin du test de McNemar ( http://en.wikipedia.org/wiki/McNemar%27s_test , http://www.ncbi.nlm.nih.gov/pmc/articles/PMC3346204/ ). Voici un exemple:
1300 pts et 1300 contrôles appariés sont étudiés. Le statut de fumeur est présenté comme suit:
Normal
|no |yes|
Cancer|No |1000|40 |
|Yes |200 |60 |
Chaque entrée du tableau montre des informations sur une PAIRE CASE-CONTROL: 1000 signifie dans 1000 paires cas-témoins, ni l'un ni l'autre n'était un fumeur. 40 est le nombre de paires cas-témoins où le témoin était fumeur et non atteint de cancer, etc. Le code R suivant peut être utilisé pour générer cette table et effectuer le test de McNemar.
mat = as.table(rbind(c(1000, 40), c( 200, 60) ))
colnames(mat) <- rownames(mat) <- c("Nonsmoker", "Smoker")
names(dimnames(mat)) = c("Cancer", "Normal")
mat
# Normal
# Nonsmoker Smoker
# Cancer
# Nonsmoker 1000 40
# Smoker 200 60
mcnemar.test(mat)
# McNemar's Chi-squared test with continuity correction
#
#data: mat
#McNemar's chi-squared = 105.34, df = 1, p-value < 2.2e-16
Le test de McNemar est également utilisé pour évaluer l'effet d'une intervention sur une variable de résultat binaire. La paire de résultats avant-après est présentée et testée comme ci-dessus.
Edit: Exemple d'extension donné par @gung, si le statut de fumeur est répertorié dans votre dataframe mydf comme suit:
pairID cancer control
1 1 1
2 1 1
3 1 0
...
Le test McNemars peut être effectué avec les commandes R suivantes:
> tt = with(mydf, table(cancer, control))
> tt
control
cancer 0 1
0 5 1
1 3 2
> mcnemar.test(tt)
McNemar`s Chi-squared test with continuity correction
data: tt
McNemar`s chi-squared = 0.25, df = 1, p-value = 0.6171
Vous avez raison de dire que le test exact de Fisher est inapproprié pour vos données. Vous devrez reformer votre table de contingence. Le nouveau tableau sera pour les paires , donc il semblera avoir deux fois moins de données représentées (dans votre cas 40 au lieu de 80). Par exemple, imaginez que vos données ressemblent à ceci (chaque ensemble de sujets jumelés est dans sa propre ligne et
1
indique un fumeur):Alors votre ancienne table de contingence aurait pu être:
Votre nouveau tableau de contingence ressemblera à ceci:
Le premier tableau de contingence se résume à 22 (le nombre total de sujets dans votre étude), mais le deuxième tableau de contingence s'élève à 11 (le nombre de paires appariées).
Avec vos données représentées de cette façon, ce qui vous intéresse, c'est si les proportions marginales sont les mêmes. Le test pour cela est le test de McNemar . J'ai expliqué le test de McNemar ici et ici .
la source
il ne devrait pas être nécessaire d'utiliser un test apparié. l'appariement des populations permet de constater que la répartition des covaraités (âge, ...) est la même dans les deux populatoins afin de ne pas "déformer" l'image.
le test compare les moyennes des populations donc un appariement d'individus n'est pas nécessaire. cela n'est nécessaire que pour les mesures "répétées", par exemple pour comparer les ménas avant et après le traitement de la même population.
la source
Oui et non:
votre cas relève probablement du cas Pearce (2015) : le point dans l'article est que les variables que vous utilisez pour sélectionner le contrôle doivent être contrôlées dans l'étude et non dans le test. Cela pourrait être difficile en raison du N = 80.
J'espère que cette aide :)
la source