J'ai créé un tracé dans ggplot2 pour résumer les données provenant d'un ensemble de données 2 x 4 x 3 cellules. J'ai pu créer des panneaux pour la variable à 2 niveaux en utilisant facet_grid(. ~ Age)et définir les axes x et y avec aes(x=4leveledVariable, y=DV). J'avais l'habitude...
J'ai du mal à comprendre la courbe ROC. Existe-t-il un avantage / amélioration de l'aire sous la courbe ROC si je construis différents modèles à partir de chaque sous-ensemble unique de l'ensemble d'apprentissage et que je l'utilise pour produire une probabilité? Par exemple, si a les valeurs de ,...
Je me demandais s'il existait de bonnes bibliothèques R pour les réseaux de neurones d'apprentissage en profondeur? Je sais qu'il ya la nnet, neuralnetet RSNNS, mais aucun d' entre eux semblent mettre en œuvre des méthodes d'apprentissage en profondeur. Je suis particulièrement intéressé par les...
Je suis en train de prédire un résultat binaire en utilisant 50 variables continues explicatives (la gamme de la plupart des variables est à ∞ ). Mon ensemble de données contient près de 24 000 lignes. Quand je cours en R, je reçois:−∞−∞-\infty∞∞\inftyglm Warning messages: 1: glm.fit: algorithm did...
J'utilise lme4 in R pour s'adapter au modèle mixte lmer(value~status+(1|experiment))) où la valeur est continue, le statut et l'expérience sont des facteurs, et je reçois Linear mixed model fit by REML Formula: value ~ status + (1 | experiment) AIC BIC logLik deviance REMLdev 29.1 46.98 -9.548...
J'ai des données provenant d'une expérience que j'ai analysée à l'aide de tests t. La variable dépendante est mise à l'échelle par intervalles et les données sont soit non appariées (c'est-à-dire 2 groupes), soit appariées (c'est-à-dire intra-sujets). Par exemple (au sein des sujets): x1 <-...
Cette question est motivée par ma question sur la méta-analyse . Mais j'imagine que cela serait également utile dans les contextes pédagogiques dans lesquels vous souhaitez créer un jeu de données qui reflète exactement un jeu de données publié existant. Je sais comment générer des données...
J'essaie de comprendre la philosophie qui sous-tend l'utilisation d'un modèle linéaire généralisé (GLM) par rapport à un modèle linéaire (LM). J'ai créé un exemple de jeu de données ci-dessous où: bûche( y) = x + εbûche(y)=X+ε\log(y) = x + \varepsilon L'exemple n'a pas l'erreur en fonction de la...
J'ai récemment mesuré la façon dont le sens d'un nouveau mot est acquis au cours d'expositions répétées (pratique: du premier au dixième jour) en mesurant les ERP (EEG) lorsque le mot a été vu dans différents contextes. J'ai également contrôlé les propriétés du contexte, par exemple son utilité...
Je voudrais autant d’algorithmes effectuant la même tâche que la régression logistique. Ce sont des algorithmes / modèles qui peuvent donner une prédiction à une réponse binaire (Y) avec une variable explicative (X). Je serais heureux si, après avoir nommé l'algorithme, vous montriez également...
Je suis nouveau dans la sélection de fonctionnalités et je me demandais comment vous utiliseriez PCA pour sélectionner des fonctionnalités. La PCA calcule-t-elle un score relatif pour chaque variable d'entrée que vous pouvez utiliser pour filtrer les variables d'entrée non informatives? En gros, je...
Dans de nombreux tutoriels ou manuels, le récit semble impliquer que R et python coexistent en tant que composants complémentaires du processus d'analyse. À mes yeux, cependant, il semble que les deux langues fassent en quelque sorte la même chose. Ma question est donc de savoir s’il existe des...
Compte tenu de toutes les bonnes propriétés des modèles d'état et de la KF, je me demande quels sont les inconvénients de la modélisation de l'espace et de l'utilisation du filtre de Kalman (ou EKF, UKF ou filtre de particules) pour l'estimation. Supposons des méthodologies conventionnelles comme...
EDIT: la vue des tâches CRAN Web Services and Services contient une liste beaucoup plus complète des sources de données et des API disponibles dans R. Vous pouvez soumettre une demande d'extraction sur github si vous souhaitez ajouter un package à la vue des tâches. Je fais une liste des différents...
Existe-t-il une transformation de type Box-Cox pour les variables indépendantes? C’est-à-dire une transformation qui optimise la variable manière à ce qu’elle corresponde mieux à un modèle linéaire?XXxy~f(x) Si oui, existe-t-il une fonction pour effectuer cela
Je lisais l'article de 2008 de Geoff Cumming sur Replication and Intervals: les valeurs ne prédisent que très vaguement l'avenir, mais les intervalles de confiance sont bien meilleurs pppppp p p[environ 200 citations dans Google Scholar] - et je suis dérouté par l'une de ses revendications...
Si je lance un randomForestmodèle, je peux alors faire des prédictions basées sur ce modèle. Existe-t-il un moyen d’obtenir un intervalle de prévision de chacune des prévisions de sorte que je sache à quel point le modèle est sûr de sa réponse. Si cela est possible, est-il simplement basé sur la...
J'ai les données d'un test qui pourrait être utilisé pour distinguer les cellules normales et les cellules tumorales. Selon la courbe ROC, cela semble bon à cet égard (la surface sous la courbe est de 0,9): Mes questions sont: Comment déterminer le point de coupure pour ce test et son intervalle de...
Un filtre à particules et un filtre de Kalman sont tous deux des estimateurs bayésiens récursifs . Je rencontre souvent des filtres de Kalman dans mon champ, mais je vois très rarement l’utilisation d’un filtre à particules. Quand l'un serait-il utilisé par rapport à
Supposons que j'ai un objet de classe glm(correspondant à un modèle de régression logistique) et j'aimerais transformer les probabilités prédites données en predict.glmutilisant l'argument type="response"en réponses binaires, c'est-à-dire ou Y = 0 . Quel est le moyen le plus rapide et le plus...