Si vous choisissez d'analyser un plan de contrôle pré-post-traitement avec une variable dépendante continue à l'aide d'une ANOVA mixte, il existe différentes façons de quantifier l'effet d'être dans le groupe de traitement. L'effet d'interaction est une option principale. En général, j'aime...
Quels sont les avantages de donner certaines valeurs initiales aux probabilités de transition dans un modèle de Markov caché? Finalement, le système les apprendra, alors quel est l'intérêt de donner des valeurs autres que aléatoires? L'algorithme sous-jacent fait-il une différence comme Baum –...
Est-ce que quelqu'un sait quelle est la formule pour la distance de Cook? La formule de distance de Cook d'origine utilise des résidus étudiés, mais pourquoi R utilise std. Pearson résiduels lors du calcul du tracé de distance de Cook pour un GLM. Je sais que les résidus studentisés ne sont pas...
Je traite généralement des données où plusieurs individus sont chacun mesurés plusieurs fois dans chacune de 2 conditions ou plus. J'ai récemment joué avec la modélisation à effets mixtes pour évaluer les preuves des différences entre les conditions, la modélisation individualcomme un effet...
On m'a récemment dit qu'il n'était pas possible d'incorporer des covariables variant dans le temps dans des modèles mixtes longitudinaux sans introduire un décalage dans le temps pour ces covariables. Pouvez-vous confirmer / nier cela? Avez-vous des références sur cette situation? Je propose une...
Existe-t-il une méthode pour comprendre si deux lignes sont (plus ou moins) parallèles? J'ai deux lignes générées à partir de régressions linéaires et je voudrais comprendre si elles sont parallèles. En d'autres termes, je voudrais obtenir les différentes pentes de ces deux lignes. Existe-t-il une...
J'ai commencé à creuser un peu dans la fonction plot.lm , cette fonction donne six tracés pour lm, ce sont: un tracé des résidus par rapport aux valeurs ajustées un graphique Scale-Location de sqrt (| résidus |) par rapport aux valeurs ajustées un tracé QQ normal, un tracé des distances de Cook par...
Je souhaite savoir s'il existe ou non un consensus sur la meilleure façon d'analyser les données sur la durée de séjour à l'hôpital à partir d'un ECR. Il s'agit généralement d'une distribution très asymétrique, où la plupart des patients sortent en quelques jours à une semaine, mais les autres...
Je cherche une implémentation de python (en python pur ou en encapsulant des trucs existants) de HMM et Baum-Welch. Quelques idées? Je viens de chercher dans google et j'ai trouvé du matériel vraiment médiocre par rapport aux autres techniques d'apprentissage automatique.
Je travaille sur un ensemble de données afin d'évaluer l'impact du séchage sur les activités microbiennes des sédiments. L'objectif est de déterminer si l'impact du séchage varie selon les types de sédiments et / ou la profondeur dans les sédiments. La conception expérimentale est la suivante: Le...
J'ai le modèle Cox PH suivant: (Heure, événement) ~ X + Y + Z Je voudrais obtenir les risques prévus taux (je parle des taux de risque NON ratios danger) , étant donné les valeurs spécifiques de X, Y, Z. Je sais que le package muhaz R peut calculer les taux de risque observés, mais je suis...
Je travaille actuellement sur un projet impliquant des GLM (et éventuellement des GAM) de certaines données de comptage au fil du temps. Normalement, je le ferais dans SAS, mais j'essaie de passer à R, et d'avoir ... des problèmes. Lorsque j'adapte un GLM pour compter les données à l'aide des...
J'ai exécuté un glm dans R, et près du bas de la summary()sortie, il indique (Dispersion parameter for gaussian family taken to be 28.35031) J'ai fait quelques recherches sur Google et j'ai appris que le paramètre de dispersion est utilisé pour ajuster les erreurs standard. J'espère que quelqu'un...
Dans un modèle de risques proportionnels de Cox avec de nombreuses variables, si les résidus de Schoenfeld ne sont pas plats pour l'une des variables, cela invalide-t-il le modèle entier ou peut-on simplement ignorer la variable peu performante? C'est-à-dire, interpréter les coefficients pour les...
Nous avons demandé à 60 personnes de répertorier autant de franchises de restaurants à Atlanta que possible. La liste globale comprenait plus de 70 restaurants, mais nous avons éliminé ceux qui étaient mentionnés par moins de 10% des gens, nous en laissant 45. Pour ces 45, nous avons calculé la...
Je voudrais utiliser lme4pour ajuster une régression à effets mixtes et multcomppour calculer les comparaisons par paire. J'ai un ensemble de données complexe avec plusieurs prédicteurs continus et catégoriques, mais ma question peut être démontrée en utilisant l' ChickWeightensemble de données...
De Wikipédia Un réseau bayésien dynamique (DBN) est un réseau bayésien qui relie des variables entre elles sur des pas de temps adjacents. Ceci est souvent appelé un BN à deux tranches de temps car il dit qu'à tout moment T, la valeur d'une variable peut être calculée à partir des régresseurs...
Contexte biologique Au fil du temps, certaines espèces végétales ont tendance à dupliquer leurs génomes entiers, obtenant une copie supplémentaire de chaque gène. En raison de l'instabilité de cette configuration, bon nombre de ces gènes sont ensuite supprimés, et le génome se réorganise et se...
Concernant la pondération du score de propension (IPTW) lors de la modélisation du risque proportionnel de Cox des données de survie dans le temps: J'ai des données de registre prospectives où nous souhaitons étudier l'effet du traitement d'un médicament que, dans la plupart des cas, les patients...
Pour les données de comptage que j'ai collectées, j'utilise la régression de Poisson pour construire des modèles. Je le fais en utilisant la glmfonction dans R, où j'utilise family = "poisson". Pour évaluer les modèles possibles (j'ai plusieurs prédicteurs) j'utilise l'AIC. Jusqu'ici tout va bien....