Questions sur les bibliothèques et les logiciels autonomes conçus ou bien adaptés aux calculs scientifiques ou numériques.
Quelqu'un a-t-il des recommandations sur une bibliothèque matricielle C ++ rapide et utilisable? Ce que je veux dire par utilisable est le suivant: Les objets matriciels ont une interface intuitive (ex.: Je peux utiliser des lignes et des colonnes lors de l'indexation) Je peux faire n'importe quoi...
Souvent, quand j'ai hérité ou rencontré du code scientifique écrit par d'autres personnes (ou parfois même par mon propre travail), j'ai remarqué que la documentation était soit rare, soit inexistante. Si j'ai de la chance, je vois des commentaires informatifs. Si j'ai beaucoup de chance, il y a...
Le logiciel est un élément fondamental de la science informatique et est de plus en plus reconnu comme un élément essentiel du dossier scientifique. Étant donné l'intérêt d'utiliser un code existant et bien testé, il semble utile de communiquer le plus largement possible l'existence de codes utiles...
Dans l'un de mes articles, j'énumère des résultats numériques en plus de certains chiffres. Ce que j'aimerais faire, c'est m'assurer que les résultats numériques dans mon papier sont toujours en accord avec le code. À l’heure actuelle, je copie directement les résultats numériques de la sortie de...
Je ne veux pas traiter avec virtualenv pour une installation Python locale, je veux juste installer quelques paquets localement sans traiter la PYTHONPATHvariable d'environnement, comment
Quelqu'un peut-il me recommander un bon système de gestion de flux de travail (WMS), de préférence en Python? Jusqu'à présent, j'utilise GNU Make, mais cela introduit une couche de complexité que je veux éviter. Un bon WMS doit avoir les caractéristiques suivantes: s'intègre facilement avec les...
Le problème Je travaille actuellement sur une simulation d'élément fini Navier Stokes et j'aimerais étudier les effets d'une variété de paramètres. Certains paramètres sont spécifiés dans un fichier d'entrée ou via une option de ligne de commande; d'autres paramètres sont fournis sous forme...
Les développeurs de logiciels ont le choix de choisir une licence appropriée en fonction des objectifs du travail. Quelqu'un peut-il donner des recommandations / expériences sur quelle licence choisir pour le logiciel? Quels sont les avantages / inconvénients de "donner" tout le travail codé en...
J'ai étudié les bibliothèques d'algèbre linéaire C ++ pour un projet sur lequel je travaillais. Quelque chose que je n'ai pas encore saisi est la connexion de BLAS et LAPACK à d'autres bibliothèques d'algèbre linéaire. En parcourant cet article sur les bibliothèques d'algèbre linéaire, j'ai trouvé...
Question connexe: état de Mac OS en calcul scientifique et HPC Un nombre important de progiciels en science informatique sont écrits en Fortran, et Fortran ne va pas disparaître. Un compilateur Fortran est également requis pour construire d'autres progiciels (un exemple notable étant SciPy )....
Étant donné une fonction réelle de variables réelles, existe-t-il un logiciel capable de générer automatiquement un code numérique précis pour calculer la fonction sur toutes les entrées d'une machine équipée de l'arithmétique IEEE 754? Par exemple, si la fonction réelle à évaluer était: Le...
Pour autant que je sache, les deux grands cadres génériques des logiciels de science informatique du Département américain de l'énergie sont PETSc et Trilinos . Ils semblent similaires à première vue, au-delà des différences de langage (C versus C ++). Quelles sont les principales différences entre...
Je n'exécute aucun code parallèle pour le moment, mais je prévois d'exécuter du code parallèle à l'avenir en utilisant un hybride d'OpenMP et de MPI. Les débogueurs ont été des outils précieux pour moi lors de l'exécution de projets en série. Quelqu'un peut-il recommander un débogueur parallèle (ou...
Cette question a été migrée à partir de Cross Validated car il est possible d'y répondre sur Computational Science Stack Exchange. Migré il y a 7 ans . Je veux apprendre la programmation MATLAB afin de pouvoir effectuer des recherches / analyses par moi-même et aussi, afin de pouvoir étudier /...
La reproductibilité est devenue de plus en plus importante dans la recherche en science informatique. (Par exemple, consultez cet article de Roger Peng dans Science ; je connais également d'autres articles et sites Web de ce type.) Cependant, je ne sais pas exactement combien d'informations je...
La recherche reproductible en calcul vise à mettre le code nécessaire pour générer les résultats dans un document de calcul à la disposition d'autres chercheurs afin qu'ils puissent exécuter ce code pour reproduire les résultats dans ce document. Je voudrais que toutes mes recherches soient...
Je me retrouve souvent à écrire du code très similaire pour les versions à une, deux et trois dimensions d'une opération / algorithme donné. La maintenance de toutes ces versions peut devenir fastidieuse. La génération de code simple fonctionne assez bien, mais il semble que l'on pense qu'il doit y...
À l'aube d'OS X, il semblait y avoir beaucoup de brouhaha, du moins dans le monde Mac (j'étais loin d'être du calcul scientifique à l'époque) à propos du Mac OS en tant que plate-forme pour le calcul scientifique et les applications HPC. XGrid est sorti de la boîte, Virginia Tech avait son cluster...
Ma thèse porte sur le développement de méthodes numériques pour la réduction des modèles de combustion. J'exécute mes méthodes uniquement sur la partie chimie des simulations de combustion, et j'ai de nombreuses études de cas pour les simulations 0-D (sans débit). Ce que j'aimerais, c'est exécuter...
La simulation multi-physique implique le couplage de plusieurs "physiques", souvent avec des échelles spatiales et / ou temporelles différentes. De plus, les codes à physique unique sont souvent écrits par différentes équipes. La technique de couplage la plus couramment utilisée est la division par...