Dans l'un de mes articles, j'énumère des résultats numériques en plus de certains chiffres. Ce que j'aimerais faire, c'est m'assurer que les résultats numériques dans mon papier sont toujours en accord avec le code. À l’heure actuelle, je copie directement les résultats numériques de la sortie de...
La reproductibilité est devenue de plus en plus importante dans la recherche en science informatique. (Par exemple, consultez cet article de Roger Peng dans Science ; je connais également d'autres articles et sites Web de ce type.) Cependant, je ne sais pas exactement combien d'informations je...
La recherche reproductible en calcul vise à mettre le code nécessaire pour générer les résultats dans un document de calcul à la disposition d'autres chercheurs afin qu'ils puissent exécuter ce code pour reproduire les résultats dans ce document. Je voudrais que toutes mes recherches soient...
Une réduction parallèle suppose que l'opération correspondante est associative. Cette hypothèse est violée pour l'ajout de nombres à virgule flottante. Vous pourriez vous demander pourquoi je m'en soucie. Eh bien, cela rend les résultats moins reproductibles. Et cela empire lorsque le recuit simulé...
J'ai écrit un programme / bibliothèque que j'ai utilisé pour obtenir des résultats dans un article. (Ici , il est , mais ma question est générale.) J'ai des tests que j'exécuté en utilisant régulièrement ctest(il faut quelques minutes à courir). Afin de reproduire certains tableaux ou figures de...
J'écris un papier reproductible, et le papier a des résultats de calcul qui sont générés par un script Python (un script MATLAB similaire génère des résultats presque identiques). Je pense que le papier serait plus facile à comprendre pour les lecteurs s'ils pouvaient faire correspondre les calculs...
Habituellement, j'écris du code série, et quand je le fais, j'écris des tests unitaires avec un cadre de test de style xUnit (MATLAB xUnit, PyUnit / nose, ou le cadre de test C ++ de Google). Sur la base d'une recherche rapide sur Google, je n'ai pas beaucoup vu comment les praticiens testent le...
La physique, la biologie, la chimie, etc. ont différents ensembles de règles pour faire des expériences: quels événements sont considérés comme pertinents, comment éviter la contamination des échantillons, comment créer et corriger un processus de reproduction, etc. Quelles sont les normes,...
Existe-t-il une liste publiée des meilleures pratiques pour assurer la longévité du code, en vue de résultats scientifiques reproductibles? (par exemple open source, pratiques de documentation, sélection des dépendances, sélection d'une langue, machines virtuelles, etc.). Connaître des études (ou,...