Je sais que cette question a été posée auparavant: Ouvrage de référence pour les études écologiques mais ce n'est pas ce que je recherche.
Ce que je recherche, c'est si quelqu'un pourrait recommander un bon livre (ou une référence canonique) sur l'écologie statistique? J'ai une très bonne compréhension des statistiques pour que le livre puisse vraiment être à n'importe quel niveau. J'utiliserais le livre pour m'apprendre davantage sur l'application des statistiques en écologie qu'autre chose, donc même un livre d'introduction avec des exemples bons / intéressants serait très apprécié. De plus, mes recherches ont tendance à être axées sur les statistiques bayésiennes, donc un livre incorporant des statistiques bayésiennes est encore mieux!
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Réponses:
Voici quelques bons livres que je recommanderais personnellement:
Hilborn & Mangel (1997) The Ecological Detective: confronter les modèles aux données . Princeton University Press.
Celui-ci concerne davantage les statistiques avec des exemples écologiques, mais il n'y a rien de mal à cela. Cela donnerait une bonne idée de la façon dont les statistiques pourraient être utilisées en écologie. Notez la date; il ne couvrira pas certains des développements ou applications les plus récents.
M. Henry H. Stevens (2009) Notions élémentaires de l' écologie avec R . Springer.
Peut-être trop basique et pas particulièrement sur quelque chose de spatial, mais il couvre les différents sujets que nous enseignerions aux écologistes et illustre la théorie écologique et les modèles avec le code R.
BM Bolker (2008) Les modèles écologiques et des données en R . Princeton University Press.
J'adore ce livre. Il couvre des sujets que vous connaissez bien en fonction de vos antécédents statistiques, mais appliqués dans un contexte écologique. Accent sur l'ajustement des modèles et leur optimisation à partir des principes de base à l'aide du code R.
James S. Clark (2007) Modèles de données écologiques: une introduction . Princeton University Press.
Ne vous laissez pas rebuter par "l'introduction" dans le titre; c'est tout sauf une introduction. Large couverture, beaucoup de théorie, accent sur l'ajustement manuel des modèles en utilisant des approches bayésiennes (le compagnon du manuel du laboratoire R discute de l'écriture de vos propres échantillonneurs Gibbs par exemple!)
Pas un livre, mais j'ajouterai ceci car vous mentionnez spécifiquement votre intérêt pour les processus gaussiens. Jetez un oeil à Integrated Nested Laplace Approximation (INLA), qui a un site Web . C'est un package R et a beaucoup d'exemples avec lesquels jouer. Si vous regardez leur FAQ, vous trouverez plusieurs articles qui décrivent l'approche, en particulier:
H. Rue, S. Martino et N. Chopin. Inférence bayésienne approximative pour les modèles gaussiens latents utilisant des approximations de Laplace imbriquées intégrées (avec discussion). Journal de la Royal Statistical Society, série B, 71 (2): 319 {392, 2009. (PDF disponible ici ).
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Quelques bons livres d'écologie basés sur les statistiques bayésiennes sont:
Kery, M. 2010. Introduction à WinBUGS pour les écologistes: approche bayésienne de la régression, ANOVA, modèles mixtes et analyses connexes . Presse académique.
Kery, M. et M. Schaub. 2011. Analyse de la population bayésienne à l'aide de WinBUGS: une perspective hiérarchique . Presse académique.
Royle, JA et RM Dorazio. 2008. Modélisation hiérarchique et inférence en écologie: l'analyse des données des populations, des métapopulations et des communautés . Presse académique
Je trouve également Zuur et al. (2009) très utile.
Zuur, A., EN Ieno, N. Walker, AA Saveliey et GM Smith. Effets mixtes modèles et extensions en écologie avec R . Springer.
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Jack Weiss (qu'il repose en paix ) était un excellent statisticien de formation qui avait également une bonne compréhension des principes écologiques / environnementaux. Il a été un consultant statistique inestimable pour les scientifiques écologiques / environnementaux aux États-Unis et même dans le monde.
Bien qu'il n'ait aucun livre à ma connaissance, ses notes de cours sont toujours disponibles en ligne :
Méthodes statistiques en écologie [ou une version 2012 ]
Statistics for Environmental Science [ou 2007 ; Version 2012 ]
Statistiques pour l'écologie et l'évolution
Écologie 145 - Analyse statistique
Je suis sûr qu'il y a une tonne de chevauchement entre les cours, mais ses notes (et code R) sont disponibles pour chacun de ces cours et devraient s'avérer très utiles à la plupart des personnes visitant ce post.
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