Quelles questions un statisticien poserait-il sur l'analyse de l'éclosion d'E. Coli?

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Vous avez peut-être entendu parler de la récente éclosion d' E. Coli entérohémorragique ( EHEC ) en Allemagne .
Quelles questions un statisticien poserait-il sur l'analyse EHEC?
Je pense à Q + Comme entre les journalistes / fonctionnaires ↔ les non-experts, disent les enseignants et les ingénieurs avec un diplôme Diplom / Master mais au plus une poignée de statistiques.

(Une image, une carte du terrain EHEC montrant diverses souches d'EHEC et la couverture de divers tests est-elle possible?)

Lundi 20 juin: Je pensais que l'épidémie d'EHEC serait un domaine où les statistiques comptent vraiment dans le monde entier: quelles sont les preuves de diverses causes, comment les communiquer au public? Donc, commencer une prime.

denis
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Je ne sais pas si ce devrait être un wiki communautaire car je pense que les votes sur les bonnes réponses devraient compter pour le représentant, et il y a une chance que vous obteniez de meilleures réponses si tel est le cas.
Jeromy Anglim

Réponses:

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Si vous n'avez pas de questions scientifiques a priori auxquelles vous voulez / devez répondre - je regarderais la distribution spatiale des cas. En particulier, j'estimerais une sorte de fonction "d'intensité" spatiale - c'est-à-dire une fonction . Afin de ne pas surcharger les données, un certain lissage serait approprié, ce qui regrouperait efficacement les emplacements voisins. L'approche la plus simple consisterait à utiliser une fonction d'estimation de la densité du noyau (par exemple la fonction kde2d dans R, bien qu'un certain prétraitement des données puisse être nécessaire). Cela aiderait à identifier les «points chauds» dans la distribution spatiale et pourrait conduire un enquêteur à identifier les réservoirs environnementaux d'E. Coli.F(s)=E(prevunelence| you unere jen locunetjeon s)

Selon les autres données dont vous disposez, des modèles spatiaux plus sophistiqués qui s'ajustent aux facteurs de confusion connus pourraient être utilisés.

Macro
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Le diagnostic des variantes d'EHEC et de leurs sources possibles semble difficile, incertain. Comme vous le savez, les responsables allemands ont d'abord dit "ce sont des concombres d'Espagne", puis des semaines plus tard "ce sont définitivement des germes" (graines, eau ...?) (Je me rends compte que beaucoup de gens veulent une réponse instantanée, et en sont servis une.) Avec symptômes clairs, une carte peut conduire à une cause, comme dans la célèbre carte de l' épidémie de choléra à Londres en 1854 . Mais la carte des épidémies EHEC ?
denis