matplotlib / seaborn: première et dernière ligne coupées en deux du tracé de la carte thermique

Lorsque vous tracez des cartes thermiques avec seaborn (et des matrices de corrélation avec matplotlib), la première et la dernière ligne sont coupées en deux. Cela se produit également lorsque j'exécute cet exemple de code minimal que j'ai trouvé en ligne.

import pandas as pd
import seaborn as sns
import matplotlib.pyplot as plt

data = pd.read_csv('https://raw.githubusercontent.com/resbaz/r-novice-gapminder-files/master/data/gapminder-FiveYearData.csv')
plt.figure(figsize=(10,5))
sns.heatmap(data.corr())
plt.show()

Les étiquettes sur l'axe y sont au bon endroit, mais les lignes n'y sont pas complètement.

Il y a quelques jours, cela fonctionnait comme prévu. Depuis, j'ai installé texlive-xetex donc je l'ai à nouveau supprimé mais cela n'a pas résolu mon problème.

Des idées de ce que je pourrais manquer?

Malheureusement, matplotlib 3.1.1 a cassé les cartes thermiques des marins ; et en général des axes inversés avec des graduations fixes.
Ce problème est résolu dans la version de développement actuelle; vous pouvez donc

• revenir à matplotlib 3.1.0
• utiliser matplotlib 3.1.2 ou supérieur
• définir les limites de la carte thermique manuellement ( ax.set_ylim(bottom, top) # set the ylim to bottom, top)

C'est un bogue dans la régression matplotlib entre 3.1.0 et 3.1.1 Vous pouvez corriger cela en:

import seaborn as sns
df_corr = someDataFrame.corr()
ax = sns.heatmap(df_corr, annot=True) #notation: "annot" not "annote"
bottom, top = ax.get_ylim()
ax.set_ylim(bottom + 0.5, top - 0.5)

Correction de l'utilisation de ce qui précède et de la définition manuelle des limites de la carte thermique.

Première

ax = sns.heatmap(...

vérifié les axes courants avec

ax.get_ylim()
(5.5, 0.5)

Fixé avec

ax.set_ylim(6.0, 0)

Je l'ai résolu en ajoutant cette ligne dans mon code, avec matplotlib==3.1.1:

ax.set_ylim(sorted(ax.get_xlim(), reverse=True))

NB. La seule raison pour laquelle cela fonctionne est que l'axe des x n'est pas modifié, alors utilisez-le à vos propres risques avec les futures versions de mpl

matplotlib 3.1.2 est sorti - Il est disponible dans le cloud Anaconda via conda-forge mais je n'ai pas pu l'installer via conda install. L'alternative manuelle a fonctionné: Téléchargez matplotlib 3.1.2 à partir de github et installez via pip

 % curl https://codeload.github.com/matplotlib/matplotlib/tar.gz/v3.1.2 --output matplotlib-3.1.2.tar.gz
 % pip install matplotlib-3.1.2.tar.gz

Cela arrive avec matplotlib version 3.1.1 comme suggéré par importanceofbeingernest

Suite a résolu mon problème

pip install matplotlib==3.1.0

rustyDev a raison à propos de conda-forge, mais je n'ai pas eu besoin de faire une installation manuelle de pip à partir d'un téléchargement github. Pour moi, sous Windows, cela fonctionnait directement. Et les parcelles sont toutes belles à nouveau.

https://anaconda.org/conda-forge/matplotlib

conda install -c conda-forge matplotlib

points facultatifs, non nécessaires pour la réponse:

Ensuite, j'ai essayé d'autres étapes, mais elles ne sont pas nécessaires: Dans l'invite conda: recherche conda matplotlib --info n'a montré aucune nouvelle information de version, les informations les plus récentes étaient pour 3.1.1. J'ai donc essayé pip en utilisant pip install matplotlib==3.1.2Mais pip dit "Exigence déjà satisfaite"

Puis obtenir la version selon medium.com/@rakshithvasudev/... python - import matplotlib - matplotlib.__version__ montre que 3.1.2 a été installé avec succès

Btw, j'ai eu cette erreur directement après la mise à jour de Spyder vers la v4.0.0. L'erreur était dans un tracé d'une matrice de confusion. Cela a déjà été mentionné il y a quelques mois. stackoverflow.com/questions/57225685/… qui est déjà lié à cette question marine.

conda installer matplotlib = 3.1.0

Cela a fonctionné pour moi et a rétrogradé matplotlib de 3.1.1 à 3.1.0 et les heatmaps ont commencé à se comporter correctement

J'ai résolu ce problème avec le code suivant: