R fortifier provoquant la déchirure des polygones

J'ai du mal à tracer mes données spatiales à l'aide de ggplot2. La carte semble bien lorsqu'elle est tracée à l'aide de spplot, donc je suppose que la déchirure se produit au stade de fortification.

Le code est comme suit:

#install the packages
library(rgdal)
library(mapproj)
library(raster)
library(rgeos)
library(ggplot2)
library(plyr)

if (!require(gpclib)) install.packages("gpclib", type="source")
gpclibPermit()

setwd("C:/Users/My Documents")

#read in laa to regional mapping
#must aggregate to higher level regions as data is provided at this higher level
laa_region_mapping <- read.csv("laa_region.csv", header = TRUE)

#read in LAA polygons
laa_polygons <- readOGR("ctyua_ew_generalised_WGS84.json", "OGRGeoJSON")

#merge by laa to add region column to polygon data
laa_polygons_with_region_data <- merge(laa_polygons, laa_region_mapping,
                                by.x = "CTYUA13NM", by.y = "LAA",
                                all.x = TRUE, all.y = TRUE)

# aggregate laa polygons by the 21 regions (aggregate by regoin_code)
region_polygons <- raster::aggregate(laa_polygons_with_region_data, "region_code")

L'agrégat a fonctionné, comme le montre le spplot (note: j'ai trouvé comment agréger par les régions de ce post SE: joindre les polygones spatiaux par code en R )

#plot the resulting polygons using spplot
spplot(region_polygons)

Mais quand je fortifie les données spatiales pour pouvoir utiliser ggplot, il y a des déchirures sur les bords.

#fortify and merge to create the data frame ggplot will show on the map
region_polygons@data$id <- rownames(region_polygons@data)
region_polygons.points <- fortify(region_polygons, region = "id")

# plot the fortified df using ggplot
ggplot(data = region_polygons.points, aes(x= long, y = lat, group = id, fill=id)) + geom_polygon()

Comment puis-je arrêter cette déchirure?

J'ai examiné des réponses similaires sur SE, mais les réponses suggèrent que le déchirement se produit lors d'une fusion ( quelle est la cause du `` déchirement '' des polygones (artefacts) à l'aide de R, ggplot et geom_polygon? ). Je pense que mon déchirement se produit au stade de la fortification, car le spplot avant la fortification semble bien.

Vous devez utiliser group=groupdans le aesmappage. Voici un exemple reproductible de votre problème:

library("ggplot2")
library("raster")

x <- getData('GADM', country='GBR', level=2)
y <- fortify(x, region="NAME_2")
head(y)
#     long   lat order  hole piece      group       id
# 1 -2.049 57.23     1 FALSE     1 Aberdeen.1 Aberdeen
# 2 -2.049 57.23     2 FALSE     1 Aberdeen.1 Aberdeen
# 3 -2.049 57.23     3 FALSE     1 Aberdeen.1 Aberdeen
# 4 -2.050 57.23     4 FALSE     1 Aberdeen.1 Aberdeen
# 5 -2.050 57.23     5 FALSE     1 Aberdeen.1 Aberdeen
# 6 -2.050 57.23     6 FALSE     1 Aberdeen.1 Aberdeen


# wrong group aesthetic
ggplot(data=y, aes(y=lat, x=long, group=id, fill=id)) +
  geom_polygon() + 
  guides(fill=FALSE)

# fixed plot
ggplot(data=y, aes(y=lat, x=long, group=group, fill=id)) +
  geom_polygon() +
  guides(fill=FALSE)