Comment les scientifiques trouvent-ils les paramètres et la topologie corrects du modèle de Markov à utiliser?

Je comprends comment un modèle de Markov caché est utilisé dans les séquences génomiques, comme la recherche d'un gène. Mais je ne comprends pas comment trouver un modèle Markov particulier. Je veux dire, combien d'États le modèle devrait-il avoir? Combien de transitions possibles? Le modèle...