Ma question s'adresse à ceux qui s'intéressent à l'algorithmique de la biologie computationnelle. Je vais suivre un cours sur la bioinformatique cet automne; le problème, cependant, est que j'ai trop peu d'expérience en biologie et en chimie pour me sentir préparé pour ce cycle de lections (j'étais plutôt faible dans ces matières à l'école).
Pourriez-vous recommander des livres qui fourniraient une bonne introduction aux questions des sciences naturelles sur lesquelles la bioinformatique se concentre?
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Mikhail Dubov
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Réponses:
Comme une réponse précédente l'a indiqué, il n'est pas absolument nécessaire d'étudier la biologie pour faire de la bioinformatique. Cependant, si vous souhaitez avoir une compréhension de base des concepts fondamentaux tels que les gènes, l'ARN, l'ADN, etc., un bon livre de biologie d'introduction devrait fournir tout ce dont vous avez besoin.
La biologie moléculaire n'est pas le genre de sujet sur lequel on peut simplement plonger. Par conséquent, pour le comprendre, vous devez faire une lecture d'introduction. Le meilleur livre est celui qui contient suffisamment de détails sans supposer que vous souhaitez devenir biologiste.
Je vous suggère de regarder Collins Outline of College Biology. La lecture des chapitres 2-5 et 12-15 devrait vous donner les informations de base que vous désirez. Un autre choix est Outline of Biology de Schaum, troisième édition, chapitres 2-4 et 7-10. Les deux livres coûtent moins de 20,00 $ et sont faciles à comprendre. J'espère que cela t'aides.
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En tant que personne issue de l'informatique et qui a dirigé une équipe développant un produit impliquant la bioinformatique, je peux comprendre le défi de choisir le domaine - mais c'est un domaine fascinant dans lequel travailler.
Comme l'a souligné @JCEHR, ce n'est pas une exigence absolue d'étudier la biologie, mais il est utile de commencer à en reprendre quelques-uns. La bioinformatique ne concerne pas seulement la biologie moléculaire, le séquençage génomique, l'expression des protéines et la structure des protéines (ne vous inquiétez pas si vous ne comprenez pas ces termes maintenant), mais je suis assez convaincu que c'est le domaine dans lequel la grande majorité de la «bioinformatique traditionnelle» est appliqué et serait au cœur de tout cours sur le sujet. L'une des caractéristiques mesurables les plus importantes de l'ADN, de l'ARN et des protéines est qu'il s'agit d'une chaîne de molécules qui peut être représentée par une chaîne logicielle - l'annotation, le stockage et la recherche (floue) de ces chaînes sont des techniques clés.
En plus d'une introduction générale à la biologie, vous pourriez également envisager de consulter un livre qui traite de la génomique. Ce qui suit a l'air bien mais c'est un peu cher:
Une introduction à la science du génome , par Greg Gibson et Spencer V. Muse
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En tant qu'informaticien qui a fait sa mineure en biochimie, ma recommandation serait le guide Cartoon de Larry Gonick sur la génétique .
Ce n'est pas une blague. Je connais plusieurs respectables bioinformaticiens qui ont appris la génétique de cette façon. Le livre explique la plupart de ce que vous devez savoir, sinon tout, et fournit les éléments visuels les plus intuitifs pour vous faire une idée des concepts sous-jacents. Et c'est une lecture amusante.
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Comme d'autres vous l'ont dit: cela dépend un peu du livre que vous allez utiliser, ainsi que des sujets enseignés. Parfois, ce sera plutôt explicite. Cependant, afin d'être mieux préparé (et de vous habituer à la terminologie), regardez quelques amorces sur le Web, comme Preparata: A Biology Primer for Computer Scientists .
Avons-nous des collègues ou le site "biostar" est-il un clone convivial? Voir la question: " Meilleures ressources pour apprendre la biologie moléculaire pour un informaticien ".
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