Existe-t-il un utilitaire comme grepou même uniqmais pour une recherche inexacte, ou devrais-je l'écrire moi-même? Je veux dire qu'il se penchera sur 90% (le nombre peut varier) correspondant, ou quelque chose comme ça. Par exemple, j'ai un fichier avec plusieurs chaînes: abc123 abd123 abc223...
input.txt (environ 30K lignes) RT|367079254|bn|ERTS01065811.1| 38 1 503 RT|367079251|bn|ERTS01065814.1| 56 3 502 RT|367079248|bn|ERTS01065817.1| 52 2 502 output.txt RT|367079254|bn|ERTS01065811.1| 38 1 503 RT|367079251|bn|ERTS01065814.1| 56 3 502 RT|367079248|bn|ERTS01065817.1| 52 2 502...
J'ai trois types de données qui sont dans différents formats; pour chaque type de données, il existe un script Python qui le transforme en un seul format unifié. Ce script Python est lent et lié au CPU (à un seul cœur sur une machine multi-cœur), donc je veux en exécuter trois instances - une pour...
Je suis nouveau dans les scripts shell. Le cœur de mon script est de trouver la différence entre deux horodatages jusqu'à quelques millisecondes. Avec moi, j'ai un fichier avec le contenu des horodatages uniquement 2012-09-13 15:00:29,290 2012-09-13 15:00:29,297 2012-09-13 15:00:29,428 2012-09-13...
Donc, j'ai une chaîne qui ressemble à ceci: AUGGCCAUGGCGCCCAGAACUGAGAUCAAUAGUACCCGUAUUAACGGGUGA Et je veux diviser la chaîne en morceaux de 3 caractères délimités par un signe «+». AUG+GCC+AUG+GCG+CCC+AGA+ACU+GAG+AUC+AAU+AGU+ACC+CGU+AUU+AAC+GGG+UGA Et je veux le faire avec mon bon ami sed. j'ai...
Existe-t-il un moyen pratique de convertir la sortie de la "arborescence" de la commande * nix au format JSON? Edit: Je pense que je n'ai pas assez bien décrit mon problème. Mon objectif est de convertir quelque chose comme: . |-- dir1 | |-- dirA | | |-- dirAA | | `-- dirBB | `-- dirB `-- dir2 |--...
J'ai un fichier comme ci-dessous: mime PI Name: ISHO SUCCESS RATE RT, Value: 95.663826 scr PI Name: RRC Access Failures due to UU, Value: 0.13394141 prog PI Name: RRC Access Failures due to UU, Value: 0.16077702 sch PI Name: RRC Access Failures due to UU, Value: 0.11781933 Je souhaite supprimer le...
Existe-t-il un programme qui peut prendre un fichier texte en clair avec de longues lignes et ajouter une nouvelle ligne après un certain nombre de caractères, en ne séparant que les mots, pour le rendre lisible? Par exemple, prenez ceci: Lorem ipsum dolor sit amet, consectetur adipiscing elit....
J'ai un fichier texte divisé comme suit: field1,field2,field3 xield1,xield2,xield3 dield1,dield2,dield3 gield1,gield2,gield3 Chacune de ces colonnes sera un paramètre d'un programme, et j'aimerais que le programme soit appelé pour chaque ligne J'espérais une boucle, quelque chose comme: for $i in...
J'ai un fichier qui contient la seule ligne ci-dessous: {machineA=[0, 1024, 4, 1028], machineB=[1, 1025, 5, 1029]} dans lequel j'ai deux jeux de données: machineA=[0, 1024, 4, 1028] machineB=[1, 1025, 5, 1029] Maintenant, je dois lire le fichier ci-dessus et le diviser de manière à pouvoir extraire...
J'ai un fichier texte de 250 Mo, le tout sur une seule ligne. Dans ce fichier, je veux remplacer les acaractères par des bcaractères: sed -e "s/a/b/g" < one-line-250-mb.txt Il échoue avec: sed: couldn't re-allocate memory Il me semble que ce type de tâche pourrait être effectué en ligne sans...
Quelqu'un peut-il suggérer une manière élégante d'accomplir cela? Contribution: test instant () test instant () ... test instant () //total 1000 lines la sortie doit être: test instant1 () test instant2 () test instant1000() Les lignes vides sont dans mes fichiers d'entrée et il y a beaucoup de...
Dans un fichier texte, je veux supprimer ,(virgules) et aussi les "(guillemets) (uniquement si les guillemets doubles contiennent des nombres séparés par des virgules). 56,72,"12,34,54",x,y,"foo,a,b,bar" Sortie attendue 56,72,123454,x,y,"foo,a,b,bar" Remarque: je montre la ligne ci-dessus à titre...
J'ai reçu un fichier .csv avec la FF FEnomenclature: $ head -n1 dotan.csv | hd 00000000 ff fe 41 00 64 00 20 00 67 00 72 00 6f 00 75 00 |..A.d. .g.r.o.u.| Lorsque awkj'utilise pour l'analyser, je reçois un tas d'octets nuls, ce qui, je le soupçonne, est dû à l'ordre des octets. Comment puis-je...
J'ai essayé d'obtenir la sortie de 2 fichiers dans un seul fichier. J'ai essayé la commande ci-dessous: cat file1 file2 mais ici, les file2données s'ajoutent à file1. Ce dont j'ai besoin, c'est de la file1première ligne suivie de la file2première ligne et de la file1deuxième ligne suivie de la...
Je cherche quelque chose qui se comporte comme Perl chomp. Je recherche une commande qui imprime simplement son entrée, moins le dernier caractère s'il s'agit d'une nouvelle ligne: $ printf "one\ntwo\n" | COMMAND_IM_LOOKING_FOR ; echo " done" one two done $ printf "one\ntwo" |
Comment créer un nouveau fichier fusionnant des colonnes sélectives à partir de deux fichiers distincts en utilisant awk? Sans gâcher l'ordre des éléments des deux fichiers. Exemple: le fichier 3 peut contenir la colonne 1,2,3 du fichier 1 et la colonne 4 du fichier 2. File 1 A 23 8 T A 63 9 9 B 45...
J'ai besoin d'identifier la position d'un caractère dans la chaîne à l'aide de la commande grep. Exemple, la chaîne est RAMSITALSKHMAN|1223333. grep -n '[^a-zA-Z0-9\$\~\%\#\^]' Comment trouver la position de |dans la chaîne
Existe-t-il un moyen pratique d'identifier les blocs de texte en double ou presque en double dans un fichier? Je veux l'utiliser pour identifier la duplication de code. Il semble qu'il existe des programmes spécialisés avec cette capacité, mais je ne cherche pas à y participer. J'espère qu'il...
J'essaie d'extraire le nom de l'application à partir d'une pscommande comme celle-ci: ps -af -u sas |grep "java"| grep -v "grep" et il produit ce qui suit: sas 24431 1 0 Oct10 ? 00:51:08 /usr/lib/jvm/java-1.7.0-oracle-1.7.0.25.x86_64/jre/bin/java -Denv=DEV -Dapp.name=myApp -Xms512m -Xmx1g...