Comment installer numpy et scipy pour python?

Je suis fatigué d’essayer d’installer numpy et scipy pour phyton 2.7.5, j’ai besoin de cette version de python car mon objectif final est d’installer la classe ( http://class-code.net/ ) et montepython ( http: // montepython .net / ).

(J'ai Ubuntu 12.04)

Lorsque j'essaie d'importer numpy ou scipy, l'erreur suivante s'affiche à chaque fois:

$ phyton2.7
>>> import numpy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined        symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

>> import scipy
Traceback (most recent call last):
File "<stdin>", line 1, in <module>
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/scipy/__init__.py", line 78, in <module>
  from numpy import show_config as show_numpy_config
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/__init__.py", line 137, in <module>
  import add_newdocs
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/add_newdocs.py", line 9, in <module>
  from numpy.lib import add_newdoc
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/__init__.py", line 4, in <module>
  from type_check import *
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/lib/type_check.py", line 8, in <module>
  import numpy.core.numeric as _nx
File "/usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/__init__.py", line 5, in <module>
  import multiarray
ImportError: /usr/lib/python2.7/dist-packages/numpy/core/multiarray.so: undefined symbol: PyUnicodeUCS4_AsUnicodeEscapeString

Afin de me débarrasser de l'erreur j'avais essayé:

1. Satisfaire aux exigences du python: $ sudo apt-get install build-essential python-dev gfortran
2. Installez avec apt-get: $ sudo apt-get install python-numpy python-scipy python-matplotlib ipython ipython-notebook python-pandas python-sympy python-nose
3. Installation requise avec pip: $ sudo pip install requests
4. ... et essayé d'installer avec pip: $ sudo pip install numpyet$ sudo pip install scipy
5. J'ai déjà l'environnement var: export PYTHONPATH=/usr/lib/python2.7/dist-packages:${PYTHONPATH} La dernière fois que j'ai installé numpy et scipy (dans l'ancienne version 10.x), cela fonctionnait pour moi.

6. sudo sh -c "wget http://python-distribute.org/distribute_setup.py -O- | python" sudo sh -c "wget https://raw.github.com/pypa/pip/master/contrib/get-pip.py -O- | python" puis installez-les tous les deux avec un pip comme dans (4)

   Mais maintenant, il semble que le serveur de python-distribute.org soit en panne. J'ai eu l'erreur suivante:

   http://python-distribute.org/distribute_setup.py
   Resolving python-distribute.org (python-distribute.org)... failed: Name or service not known.
   wget: unable to resolve host address `python-distribute.org'
   

7. J'avais aussi essayé d'installer numpy et scipy à partir du logiciel Synaptic et du centre logiciel Ubuntu

J'avais échoué dans chacune de ces tentatives et maintenant je ne sais pas quoi faire. Est-ce que je manque quelque chose? Comment obtenir numpy et scipy correctement installés pour python? Toute idée sera appréciée.

quand je fais

echo $PYTHONPATH

Je reçois

/usr/lib/python2.7/dist-packages

Ok, suivons le guide d'installation :

1. Il dit que vous avez besoin de Python 2.7 (que vous avez déjà):

   $ python --version
   Python 2.7.4
   

2. Ensuite, il est indiqué que vous avez également besoin du paquet numpy, version> = 1.4.1:

   politique apt-cache python-numpy
   python-numpy:
   Installé: (aucun)
   Candidat: 1: 1.7.1-1ubuntu1
   Tableau de version:
    1: 1.7.1-1ubuntu1 0
       500 paquets http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main amd64

   Comme vous pouvez le constater, j’ai la version 1.7.1 de numpy disponible, nous allons donc procéder à son installation:

   sudo apt-get install python-numpy

3. Maintenant, il est dit que nous avons besoin de cython, vérifions si ce paquet est disponible:

   politique d'apt-cache
   Cython:
   Installé: (aucun)
   Candidat: 0.17.4-0ubuntu1
   Tableau de version:
    0.17.4-0ubuntu1 0
       500 paquets http://archive.ubuntu.com/ubuntu/ raring / main amd64

   Nous l'avons, nous l'installons:

   sudo apt-get install cython

   S'il vous plaît, notez qu'il y a d'autres paquets qui sont des dépendances qui sont également installés.

4. Curieusement, nous avons également besoin du module scipy:

   sudo apt-get install python-scipy

5. Test . Ouvrez python dans un terminal et tapez ce qui suit:

   $ python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26) 
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> import numpy
   >>> import scipy
   >>> import cython
   >>> exit()
   

   Ce qui précède doit être sans erreur. Si quelque chose ne va pas, relisez le guide et relisez-le, vous avez oublié / sauté une étape.

6. En téléchargeant les sources CLASS à partir de leur page, accédez au répertoire du terminal, décompressez-le et effectuez-le:

   cd où / le / tar / est
   tar zxf class_v2.0.2.tar.gz
   cd class_v2.0.2
   faire

   Ici, nous attendrons que ce soit terminé. Une fois que cela est fait, nous allons dans le répertoire python et commençons la magie. Sans quitter les répertoires, lancez ceci:

   cd python
   construction de python.py
   python setup.py install --user

   Nous avons maintenant CLASS installé dans notre répertoire utilisateur. Nous devrions le tester!

   python
   Python 2.7.4 (default, Sep 26 2013, 03:20:26)
   [GCC 4.7.3] on linux2
   Type "help", "copyright", "credits" or "license" for more information.
   >>> from classy import Class
   >>> exit()
   

   Tout est bien cozzy jusqu'à ici.

7. Maintenant le temps de la vérité, téléchargez monthypython dans le répertoire de votre code:

   cd ~
   code mkdir
   code cd
   wget https://www.dropbox.com/s/l7mnhwsktp1m8b5/montepython_v1.2.5.tar.bz2?dl=1 -O montepython_v1.2.5.tar.bz2
   tar jxf montepython_v1.2.5.tar.bz2

   Dans les instructions d'installation, certaines notes ne sont pas pertinentes dans ce cas particulier (une nouvelle installation), mais cela peut être important lorsque vous mettez à jour montepython.

8. Ce changement est important. Vous vous rappelez où vous avez installé CLASS? Maintenant, vous devriez dire à Monte Python où se trouve cela. Dans mon cas /home/braiam/src/class_v2.0.2/class, le vôtre peut être différent. Vous pouvez utiliser findpour chercher:

   find ~ -name class -print

   Bien, maintenant je modifie le default.conffichier en utilisant ce que vous voulez (je vais utiliser nano) et modifie le rootchemin, ainsi le fichier complet ressemblera à ceci:

   # Fill in the relevant path to your personal distribution. 
   # If you create a new file out of this one, please remember to call
   # MontePython.py with the option '-conf my.conf'
   
   # At minimum, this file should contain one line:
   # ** path['cosmo'] =  path to the cosmological code you are using. Note, if you are
   # using a modified version of class, be sure that the path contains the word
   # class, otherwise the code might not recognise it.
   
   # If you want to use a data folder different from the one present in the folder
   # you are executing the code, please also add:
   # ** path['data']  =  /path/to/the/other/data/
   
   root = '/home/braiam/src/class_v2.0.2/'
   
   path['cosmo']           = root+'/class/'
   

   Enregistrez le fichier et quittez.

9. Testez montepython! Si tout s'est bien code/MontePython.py --helppassé , vous devriez pouvoir exécuter votre répertoire montepythong et tout devrait fonctionner:

   ~ / src / montepython $ code / MontePython.py --help
   utilisation: MontePython.py [-h] [-N nombre d'étapes] [-o dossier de sortie]
                     [-p fichier de paramètres d'entrée] [-c matrice de cov d'entrée]
                     [-j méthode de saut] [-f facteur de saut]
                     [fichier de configuration -conf] [numéro de chaîne du numéro de chaîne]
                     [-r redémarrer à partir de la chaîne] [-bf redémarrer à partir du fichier le mieux ajusté]
                     [-info [informations de calcul du fichier souhaité [informations de calcul du fichier souhaité ...]]]
                     [-bins nombre souhaité de bacs, la valeur par défaut est 20] [-no_mean]
                     [dossier de comparaison -comp]
                     [fichier de tracé supplémentaire pour les besoins personnalisés] [-noplot] [-all]
                     [extension de changement de texte pour le fichier de sortie]
                     [-fontsize la taille de police souhaitée, la valeur par défaut est 15]
                     [-ticksize la taille de tick désirée, la valeur par défaut est 13]
   
   Monte Python, un code Monte Carlo en Python
   
   
   arguments optionnels:
   -h, --help affiche ce message d'aide et quitte
   -N nombre d'étapes
   -o dossier de sortie
   -p fichier de paramètres d'entrée
   -c cov matrice d'entrée
   -j méthode de saut
   facteur de saut
   -conf fichier de configuration
   -chain_number numéro de chaîne
   -r redémarrer de la chaîne
   -bf redémarre à partir du meilleur fichier
   -info [informations de calcul du fichier souhaité [informations de calcul du fichier souhaité ...]]
   -bins nombre souhaité de bacs, la valeur par défaut est 20
   -aucune signification
   dossier de comparaison -comp
   fichier de tracé extra pour des besoins personnalisés
   -nouveau
   -tout
   -ext change extension pour le fichier de sortie
   -fontsize la taille de police souhaitée, la valeur par défaut est 15
   Choisissez la taille désirée, la valeur par défaut est 13

Avec cela, vous avez montepython installé et prêt à rouler!