Vous ne dites pas de quelle version de Windows vous parlez (si vous demandez une version spécifique).
Sous Vista, la mise à jour Windows utilise les points de restauration du système - elle en crée un avant d'installer les mises à jour (même, de manière assez ennuyeuse, les mises à jour du modèle Windows Defender).
Vous pouvez empêcher Windows Installer de créer des points de restauration système en définissant (ou en créant) la clé de registre HKLM \ SOFTWARE \ Policies \ Microsoft \ Windows \ Installer \ LimitSystemRestoreCheckpointing avec une valeur de 1.
Une façon plus pratique de le faire sur Business et Ultimate consiste à exécuter gpedit.msc et dans Configuration ordinateur, Modèles d'administration, Composants Windows, Windows Installer, double-cliquez sur «Désactiver la création des points de contrôle de restauration du système» et définissez-le sur Activé.
Sachez que cela désactiverait la création de points de restauration système pour TOUTES les installations de logiciels, pas seulement les mises à jour Windows.
Je ne connais aucun moyen de modifier le comportement de Windows Update.