Où est passée ma RAM?

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Remarque: avant de sauter trop vite, oui j'ai lu linuxatemyram.com !

J'ai un serveur avec 64 Go de RAM.

free -m dit que ma RAM est pleine, et ce n'est pas à cause de la mise en cache du disque:

             total       used       free     shared    buffers     cached
Mem:         64458      64117        340        201         67        331
-/+ buffers/cache:      63719        739
Swap:         1532        383       1149

Cependant, l' topordre par utilisation de la mémoire ne correspond pas à 64 Go:

KiB Mem:  66005116 total, 65652464 used,   352652 free,    67512 buffers
KiB Swap:  1569780 total,   392656 used,  1177124 free.   337464 cached Mem

  PID USER      PR  NI    VIRT    RES    SHR S  %CPU %MEM     TIME+ COMMAND
 6258 mysql     20   0 38.665g 0.033t   4924 S   1.3 54.3 482:26.21 mysqld
 2293 root      20   0  165896 102116 101964 S   0.0  0.2   0:43.53 systemd-journal
 4909 root      20   0  377548  57840  57548 S   0.0  0.1   0:18.47 rsyslogd
26639 www       20   0  650076  53348  32968 S   0.0  0.1  11:32.27 php-fpm
26640 www       20   0  648344  51912  32984 S   0.0  0.1  11:37.43 php-fpm
26642 www       20   0  648600  51472  32580 S   0.0  0.1  11:37.16 php-fpm
26669 www       20   0  648148  50696  31988 S   0.0  0.1  11:35.24 php-fpm
26643 www       20   0  648452  50616  31628 S   0.0  0.1  11:36.19 php-fpm
26641 www       20   0  648620  50496  31340 S   0.0  0.1  11:36.51 php-fpm
28121 www       20   0  648620  48820  29660 S   0.0  0.1  11:35.75 php-fpm
27231 www       20   0  647508  48804  30760 S   0.0  0.1  11:35.61 php-fpm
28029 www       20   0  648044  48752  30172 S   0.0  0.1  11:37.20 php-fpm
28117 www       20   0  647868  48700  30296 S   0.0  0.1  11:36.45 php-fpm
28122 www       20   0  648340  48568  29676 S   0.0  0.1  11:35.73 php-fpm
 8569 www       20   0  649028  40268  20704 S   0.0  0.1  11:31.50 php-fpm
10126 www       20   0  648432  39420  20700 S   0.0  0.1   9:58.52 php-fpm
22386 www       20   0  647996  39400  20868 S   0.0  0.1  11:25.00 php-fpm
 9643 www       20   0  647976  39220  20704 S   0.0  0.1  11:29.23 php-fpm
23077 www       20   0  647852  39084  20692 S   0.0  0.1  11:11.80 php-fpm
10139 www       20   0  647580  38808  20692 S   0.0  0.1   9:59.94 php-fpm
 6326 www       20   0  647368  38396  20696 S   0.7  0.1   8:32.34 php-fpm
 4727 www       20   0  646128  37304  20692 S   0.0  0.1   8:30.20 php-fpm
 5459 www       20   0  645988  37156  20688 S   0.0  0.1   7:15.13 php-fpm
 2173 www       20   0  645240  36408  20684 S   0.0  0.1   4:39.13 php-fpm
20752 www       20   0  644536  35428  20680 S   0.0  0.1   4:29.78 php-fpm
 5396 www       20   0  644468  35324  20692 S   0.0  0.1   4:14.65 php-fpm
17558 www       20   0  642668  33816  20740 S   0.0  0.1   1:28.34 php-fpm
28133 www       20   0  642780  33636  20704 S   0.0  0.1   0:49.88 php-fpm
10925 www       20   0  479584  29264  11212 S   3.0  0.0   0:00.09 php
26632 root      20   0  552136  26072  19468 S   0.0  0.0   0:37.74 php-fpm
 4946 named     20   0  697996  18748   2104 S   0.0  0.0   3:46.96 named
15609 apache    20   0 2137056   8120   1592 S   0.0  0.0   0:56.18 httpd
 8584 root      20   0  133432   4864   3700 S   0.0  0.0   0:00.08 sshd

MySQL utilise à lui seul 54,3%, ce qui est parfaitement normal car il a un innodb_buffer_pool_sizede 32G. L'utilisation de la mémoire des autres processus représente environ 2,8%, soit un total de 57,1%.

Où sont les 32% restants?


Modifier: contenu de /proc/meminfo:

MemTotal:       66005116 kB
MemFree:          353272 kB
Buffers:           66328 kB
Cached:           736620 kB
SwapCached:        11348 kB
Active:         34396680 kB
Inactive:        2651132 kB
Active(anon):   34223240 kB
Inactive(anon):  2228020 kB
Active(file):     173440 kB
Inactive(file):   423112 kB
Unevictable:           0 kB
Mlocked:               0 kB
SwapTotal:       1569780 kB
SwapFree:        1177448 kB
Dirty:               328 kB
Writeback:             0 kB
AnonPages:      36234364 kB
Mapped:           125208 kB
Shmem:            206396 kB
Slab:           28058904 kB
SReclaimable:   28010224 kB
SUnreclaim:        48680 kB
KernelStack:        2760 kB
PageTables:        94780 kB
NFS_Unstable:          0 kB
Bounce:                0 kB
WritebackTmp:          0 kB
CommitLimit:    34572336 kB
Committed_AS:   38572348 kB
VmallocTotal:   34359738367 kB
VmallocUsed:      382304 kB
VmallocChunk:   34359353572 kB
HardwareCorrupted:     0 kB
DirectMap4k:        9000 kB
DirectMap2M:     2054144 kB
DirectMap1G:    67108864 kB

Sortie de slabtop:

 Active / Total Objects (% used)    : 147380425 / 147413026 (100.0%)
 Active / Total Slabs (% used)      : 7005839 / 7005839 (100.0%)
 Active / Total Caches (% used)     : 71 / 144 (49.3%)
 Active / Total Size (% used)       : 27615020.12K / 27627490.91K (100.0%)
 Minimum / Average / Maximum Object : 0.01K / 0.19K / 16.12K

  OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME
146851887 146851887  12%    0.19K 6992947       21  27971788K dentry
124936 124936 100%    0.07K   2231       56      8924K Acpi-ParseExt
105144 105144 100%    0.10K   2696       39     10784K buffer_head
 49920  49172  98%    0.06K    780       64      3120K kmalloc-64
 29916  29916 100%    0.11K    831       36      3324K sysfs_dir_cache
 29856  29661  99%    0.12K    933       32      3732K kmalloc-128
 21450  21128  98%    0.18K    975       22      3900K vm_area_struct
 19328  19328 100%    0.03K    151      128       604K kmalloc-32
 18258  13383  73%    0.93K    537       34     17184K ext4_inode_cache
 17952  11651  64%    0.04K    176      102       704K ext4_extent_status
 16828   6513  38%    0.55K    601       28      9616K radix_tree_node
 14400  13996  97%    0.06K    225       64       900K anon_vma
 11645   7903  67%    0.05K    137       85       548K shared_policy_node
 10710   7006  65%    0.19K    510       21      2040K kmalloc-192
 10608  10608 100%    0.04K    104      102       416K Acpi-Namespace
  9728   9728 100%    0.01K     19      512        76K kmalloc-8
...
Benjamin
la source
3
relisez linuxatemyram.com. Lisez ensuite kernel.org/doc/gorman/html/understand
symcbean
Je l'ai relu, et cela finit par suggérer que free -mc'est la voie à suivre pour vraiment utiliser la mémoire. De plus, le fait que l'utilisation du swap ne soit pas 0 m'a rendu un peu douteux. J'ai vérifié votre lien, mais il y a tellement de données à lire que je ne peux tout simplement pas gérer tout cela pour le moment, j'ai peur.
Benjamin
S'agit-il d'un serveur physique?
Optichip
@Optichip Il s'agit d'un serveur physique.
Benjamin
5
@AndrewSchulman Je ne pense pas que ce soit une question, c'est un double de cette question particulière. Cette question concerne la mémoire utilisée pour les dalles. L'autre question ne mentionne pas du tout les dalles.
kasperd

Réponses:

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  OBJS ACTIVE  USE OBJ SIZE  SLABS OBJ/SLAB CACHE SIZE NAME
146851887 146851887  12%    0.19K 6992947       21  27971788K dentry

Vous dites que ce n'est pas à cause de la mise en cache du disque, mais c'est clairement le cas.

Je parie que vous avez du code qui fait beaucoup de récupérations pour les fichiers qui n'existent pas et vous obtenez une tonne de mise en cache négative. Linux supprimera ces entrées s'il est soumis à une pression sur la mémoire, il ne doit donc pas vous inquiéter. Par exemple, comme dans ce numéro NSS .

David Schwartz
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5
Ah, ça pourrait expliquer ça. Veuillez pardonner mon ignorance, je pensais que cela free -mseul indiquerait si la mémoire était consommée à cause de la mise en cache du disque. Je ne connaissais pas non plus la "mise en cache négative", il serait vraiment intéressant de comprendre ce qui essaie de trouver des fichiers qui n'existent pas. Une idée de comment je pourrais enquêter là-dessus, par curiosité? Il s'agit d'une installation récente avec juste une base de données + une application Web, donc je suis vraiment surpris de voir ce comportement.
Benjamin
@Benjamin Suivez mon lien pour un exemple de la façon dont cela peut se produire. Regardez également ce que fait réellement l'application Web.
David Schwartz
10
En fait, j'utilise beaucoup libcurl, plus précisément ses liaisons PHP. Mon serveur Web télécharge et traite de nombreuses images: elles sont téléchargées en mémoire, traitées, puis téléchargées sur S3, sans jamais toucher le système de fichiers. Par conséquent, je dois admettre que j'ai négligé votre lien, le considérant trop localisé à première vue pour avoir un impact sur moi, mais cela pourrait très bien être exactement ce problème: j'ai couru de la même manière strace curlque le gars, et j'ai trouvé qu'il générait 7421 ENOENT (No such file or directory) pour un seul requete! Ça doit être ça. Merci beaucoup!
Benjamin
2
Vous voudrez peut-être voir linux-mm.org/Drop_Caches et faire echo 2 > /proc/sys/vm/drop_cachespour supprimer de manière non destructive les caches dentry et inode, et voir si votre RAM revient. De toute évidence, mieux fait à un moment calme.
abligh
1
Une confirmation supplémentaire que Linux supprimera ces entrées si sous pression vient du fait que la majeure partie des dalles actives ( Slaben /proc/meminfo) est sous SReclaimable(qui, comme son nom l'explique, peut être récupérée si nécessaire).
Marco Leogrande
4

Il peut s'agir encore de structures internes du noyau et de choses liées au système de fichiers / répertoire. Ceci est également parfaitement normal même s'il est déroutant; essayez de voir quelle est la sortie de slabtopet cat /proc/meminfo.

Janne Pikkarainen
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J'ai ajouté la sortie de ces commandes à ma question, pourriez-vous s'il vous plaît jeter un oeil?
Benjamin
1
Eh bien, environ 27 gigaoctets de votre RAM semblent être consommés par le noyau, et la majeure partie de cela va aux dentryentrées du répertoire. Je suppose que vous avez beaucoup, beaucoup de fichiers dans votre système de fichiers. Ce ne sont pratiquement que des éléments mis en cache, au cas où certains processus auraient vraiment besoin de la mémoire, ils seront libérés de la même manière qu'avec le tampon / cache normal que vous avez tendance à voir dans la sortie supérieure.
Janne Pikkarainen
C'est bon à savoir, merci. Je suis juste surpris cependant car je n'ai pas beaucoup de fichiers sur le système de fichiers: des find / | wc -lretours 134578, pas des millions comme dentrypourrait le suggérer. Avez-vous une idée de ce qui pourrait faire cela?
Benjamin
Probablement trouvé ce qui génère ces entrées de répertoire indésirable, grâce à la réponse de David Schwartz ci-dessus. Merci pour votre aide quand même!
Benjamin