Pourquoi mon xlabel est-il coupé dans mon tracé matplotlib?

Je trace un ensemble de données en utilisant matplotliboù j'ai un xlabel qui est assez "grand" (c'est une formule rendue dans TeX qui contient une fraction et a donc l'équivalent en hauteur de quelques lignes de texte).

Dans tous les cas, le bas de la formule est toujours coupé lorsque je dessine les chiffres. Changer la taille de la figure ne semble pas aider cela, et je n'ai pas été en mesure de comprendre comment déplacer l'axe x "vers le haut" pour faire de la place pour le xlabel. Quelque chose comme ça serait une solution temporaire raisonnable, mais ce qui serait bien serait d'avoir un moyen pour que matplotlib reconnaisse automatiquement que l'étiquette est coupée et redimensionnée en conséquence.

Voici un exemple de ce que je veux dire:

import matplotlib.pyplot as plt

plt.figure()
plt.ylabel(r'$\ln\left(\frac{x_a-x_b}{x_a-x_c}\right)$')
plt.xlabel(r'$\ln\left(\frac{x_a-x_d}{x_a-x_e}\right)$')
plt.show()

tandis que vous pouvez voir l'intégralité du ylabel, le xlabel est coupé en bas.

Dans le cas où il s'agit d'un problème spécifique à la machine, je l'exécute sur OSX 10.6.8 avec matplotlib 1.0.0

Utilisation:

import matplotlib.pyplot as plt

plt.gcf().subplots_adjust(bottom=0.15)

pour faire de la place au label.

Éditer:

Depuis que j'ai donné la réponse, matplotliba ajouté la tight_layout()fonction. Je suggère donc de l'utiliser:

plt.tight_layout()

devrait faire de la place pour le xlabel.

Une option simple consiste à configurer matplotlib pour ajuster automatiquement la taille du tracé. Cela fonctionne parfaitement pour moi et je ne sais pas pourquoi il n'est pas activé par défaut.

Méthode 1

Réglez cela dans votre fichier matplotlibrc

figure.autolayout : True

Voir ici pour plus d'informations sur la personnalisation du fichier matplotlibrc: http://matplotlib.org/users/customizing.html

Méthode 2

Mettez à jour les rcParams pendant l'exécution comme ceci

from matplotlib import rcParams
rcParams.update({'figure.autolayout': True})

L'avantage d'utiliser cette approche est que votre code produira les mêmes graphiques sur des machines configurées différemment.

Dans le cas où vous souhaitez le stocker dans un fichier, vous le résolvez en utilisant l' bbox_inches="tight"argument:

plt.savefig('myfile.png', bbox_inches = "tight")

Mettre plot.tight_layout()après toutes les modifications sur le graphique, juste avant show()ou savefig()résoudra le problème.

plt.autoscale() travaillé pour moi.

Vous pouvez également définir le remplissage personnalisé comme valeurs par défaut dans votre $HOME/.matplotlib/matplotlib_rccomme suit. Dans l'exemple ci-dessous, j'ai modifié le rembourrage inférieur et gauche prêt à l'emploi:

# The figure subplot parameters.  All dimensions are a fraction of the
# figure width or height
figure.subplot.left  : 0.1 #left side of the subplots of the figure
#figure.subplot.right : 0.9 
figure.subplot.bottom : 0.15
...