Fichier d'environnement d'exportation Anaconda

Comment puis-je créer un fichier d'environnement anaconda qui pourrait être utilisé sur d'autres ordinateurs?

J'ai exporté mon environnement python anaconda vers YML en utilisant conda env export > environment.yml. L'exporté environment.ymlcontient cette ligne prefix: /home/superdev/miniconda3/envs/juicyenvqui correspond à l'emplacement de mon anaconda qui sera différent sur les autres ordinateurs.

Je ne trouve rien dans les condaspécifications qui vous permette d'exporter un fichier d'environnement sans la prefix: ...ligne. Cependant, comme Alex l'a souligné dans les commentaires, conda ne semble pas se soucier de la ligne de préfixe lors de la création d'un environnement à partir d'un fichier.

Dans cet esprit, si vous souhaitez que l'autre utilisateur n'ait aucune connaissance de votre chemin d'installation par défaut, vous pouvez supprimer la ligne de préfixe avec grepavant d'écrire dans environment.yml.

conda env export | grep -v "^prefix: " > environment.yml

Dans tous les cas, l'autre utilisateur exécute alors:

conda env create -f environment.yml

et l'environnement sera installé dans leur chemin d'environnement conda par défaut.

Si vous souhaitez spécifier un chemin d'installation différent de celui par défaut pour votre système (non lié au 'préfixe' dans l'environnement.yml), utilisez simplement l' -pindicateur suivi du chemin requis.

conda env create -f environment.yml -p /home/user/anaconda3/envs/env_name

Notez que Conda recommande de créer le environment.ymlà la main, ce qui est particulièrement important si vous souhaitez partager votre environnement sur plusieurs plates-formes (Windows / Linux / Mac). Dans ce cas, vous pouvez simplement omettre la prefixligne.

Le moyen le plus simple d'enregistrer les packages d'un environnement à installer sur un autre ordinateur est:

$ conda list -e > req.txt

alors vous pouvez installer l'environnement en utilisant

$ conda create -n new environment --file req.txt

si vous utilisez pip, veuillez utiliser les commandes suivantes: référence https://pip.pypa.io/en/stable/reference/pip_freeze/

$ env1/bin/pip freeze > requirements.txt
$ env2/bin/pip install -r requirements.txt

• Linux

  conda env export --no-builds | grep -v "prefix"> environment.yml

• les fenêtres

  conda env export --no-builds | findstr -v "prefix"> environment.yml

Justification: Par défaut, conda env exportinclut les informations de construction:

$ conda env export
...
dependencies:
  - backcall=0.1.0=py37_0
  - blas=1.0=mkl
  - boto=2.49.0=py_0
...

Vous pouvez à la place exporter votre environnement sans informations de build:

$ conda env export --no-builds
...
dependencies:
  - backcall=0.1.0
  - blas=1.0
  - boto=2.49.0
...

Ce qui délie l'environnement de la version Python et du système d'exploitation.

Je trouve qu'exporter les paquets uniquement au format chaîne est plus portable que d'exporter tout l' condaenvironnement. Comme la réponse précédente l'a déjà suggéré:

$ conda list -e > requirements.txt

Cependant, il requirements.txtcontient des numéros de build qui ne sont pas portables entre les systèmes d'exploitation, par exemple entre Macet Ubuntu. Dans conda env exportnous avons l'option --no-buildsmais pas avec conda list -e, donc nous pouvons supprimer le numéro de build en émettant la commande suivante:

$ sed -i -E "s/^(.*\=.*)(\=.*)/\1/" requirements.txt 

Et recréez l'environnement sur un autre ordinateur:

conda create -n recreated_env --file requirements.txt 

1. Commencez par activer votre environnement conda (celui que vous souhaitez exporter / sauvegarder)

conda activate myEnv

2. Exporter tous les packages dans un fichier (myEnvBkp.txt)

conda list --explicit > myEnvBkp.txt

3. Restaurer / importer l'environnement:

conda create --name myEnvRestored --file myEnvBkp.txt