GraphViz - Comment connecter des sous-graphes?

Dans le DOTlangage pour GraphViz, j'essaye de représenter un diagramme de dépendance. J'ai besoin de pouvoir avoir des nœuds à l'intérieur d'un conteneur et de pouvoir rendre les nœuds et / ou conteneurs dépendants d'autres nœuds et / ou conteneurs.

J'utilise subgraphpour représenter mes conteneurs. La liaison de nœuds fonctionne très bien, mais je ne peux pas comprendre comment connecter des sous-graphiques.

Compte tenu du programme ci-dessous, je dois être capable de me connecter cluster_1et cluster_2avec une flèche, mais tout ce que j'ai essayé crée de nouveaux nœuds au lieu de connecter les clusters:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana"];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Renders fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Both of these create new nodes
    cluster_1 -> cluster_2;
    "Container A" -> "Container C";
}

Le manuel de l'utilisateur du DOT donne l'exemple suivant d'un graphe avec des clusters avec des arêtes entre les clusters:

IMPORTANT: la compound=truedéclaration initiale est requise.

digraph G {
  compound=true;
  subgraph cluster0 {
    a -> b;
    a -> c;
    b -> d;
    c -> d;
  }
  subgraph cluster1 {
    e -> g;
    e -> f;
  }
  b -> f [lhead=cluster1];
  d -> e;
  c -> g [ltail=cluster0,lhead=cluster1];
  c -> e [ltail=cluster0];
  d -> h;
}

... et les arêtes entre les nœuds et les clusters:

Pour faciliter la référence, la solution décrite dans la réponse de HighPerformanceMark, appliquée directement à la question d'origine, ressemble à ceci:

digraph G {

    graph [fontsize=10 fontname="Verdana" compound=true];
    node [shape=record fontsize=10 fontname="Verdana"];

    subgraph cluster_0 {
        node [style=filled];
        "Item 1" "Item 2";
        label = "Container A";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_1 {
        node [style=filled];
        "Item 3" "Item 4";
        label = "Container B";
        color=blue;
    }

    subgraph cluster_2 {
        node [style=filled];
        "Item 5" "Item 6";
        label = "Container C";
        color=blue;
    }

    // Edges between nodes render fine
    "Item 1" -> "Item 2";
    "Item 2" -> "Item 3";

    // Edges that directly connect one cluster to another
    "Item 1" -> "Item 3" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_1];
    "Item 1" -> "Item 5" [ltail=cluster_0 lhead=cluster_2];
}

Le contenu de compound=truela graphdéclaration est vital. Cela produit une sortie:

Notez que j'ai changé les arêtes en nœuds de référence dans le cluster, ajouté les attributs ltail et lhead à chaque arête, en spécifiant le nom du cluster, et ajouté l'attribut de niveau graphique «composé = vrai».

En ce qui concerne le souci que l'on puisse vouloir connecter un cluster sans nœuds à l'intérieur, ma solution a été de toujours ajouter un nœud à chaque cluster, rendu avec style = texte en clair. Utilisez ce nœud pour étiqueter le cluster (au lieu de l'attribut intégré "label" du cluster, qui doit être défini sur la chaîne vide (en Python, label='""'). Cela signifie que je n'ajoute plus d'arêtes qui connectent directement les clusters, mais cela fonctionne dans ma situation particulière.

Assurez-vous que vous utilisez la fdpmise en page pour le fichier. Je ne pense pas qu'il neatoprenne en charge les clusters.