Installer SciPy et NumPy à l'aide de pip

J'essaie de créer les bibliothèques requises dans un package que je distribue. Il nécessite à la fois les bibliothèques SciPy et NumPy . Lors du développement, j'ai installé les deux en utilisant

apt-get install scipy

qui a installé SciPy 0.9.0 et NumPy 1.5.1, et cela a bien fonctionné.

Je voudrais faire de même en utilisant pip install- afin de pouvoir spécifier des dépendances dans un setup.py de mon propre package.

Le problème est que lorsque j'essaye:

pip install 'numpy==1.5.1'

ça fonctionne bien.

Mais alors

pip install 'scipy==0.9.0'

échoue lamentablement, avec

raise self.notfounderror(self.notfounderror.__doc__)

numpy.distutils.system_info.BlasNotFoundError:

Blas (http://www.netlib.org/blas/) libraries not found.

Directories to search for the libraries can be specified in the

numpy/distutils/site.cfg file (section [blas]) or by setting

the BLAS environment variable.

Comment le faire fonctionner?

J'assume l'expérience Linux dans ma réponse; J'ai trouvé qu'il y avait trois conditions préalables pour pip install scipypouvoir procéder correctement.

Allez ici: Installer SciPY

Suivez les instructions pour télécharger, créer et exporter la variable env pour BLAS , puis LAPACK . Veillez à ne pas simplement couper et coller aveuglément les commandes du shell - vous devrez sélectionner quelques lignes en fonction de votre architecture, etc., et vous devrez corriger / ajouter les répertoires corrects qu'il suppose à tort comme bien.

La troisième chose dont vous pourriez avoir besoin est d' installer yum numpy-f2py ou l'équivalent.

Oh, oui et enfin, vous devrez peut-être yum installer gcc-gfortran car les bibliothèques ci-dessus sont des sources Fortran .

Cela a fonctionné pour moi sur Ubuntu 14.04:

sudo apt-get install libblas-dev liblapack-dev libatlas-base-dev gfortran
pip install scipy

vous avez besoin des packages de développement libblas et liblapack si vous utilisez Ubuntu.

aptitude install libblas-dev liblapack-dev
pip install scipy

Puisque les instructions précédentes pour l'installation avec yum sont brisées, voici les instructions mises à jour pour l'installation sur quelque chose comme fedora. J'ai testé ceci sur "Amazon Linux AMI 2016.03"

sudo yum install atlas-devel lapack-devel blas-devel libgfortran
pip install scipy

Je travaillais sur un projet qui reposait sur numpy et scipy. Dans une installation propre de Fedora 23, en utilisant un environnement virtuel python pour Python 3.4 (a également fonctionné pour Python 2.7), et avec ce qui suit dans mon setup.py (dans la setup()méthode)

setup_requires=[
    'numpy',
],
install_requires=[
    'numpy',
    'scipy',
],

J'ai découvert que je devais exécuter ce qui suit pour me rendre pip install -e .au travail:

pip install --upgrade pip

et

sudo dnf install atlas-devel gcc-{c++,gfortran} subversion redhat-rpm-config

Le redhat-rpm-configest à l'usage de Scipy redhat-hardened-cc1par opposition à la version régulièrecc1

Sur Windows python 3.5 , j'ai réussi à installer scipyen n'utilisant conda pas pip :

conda install scipy

De quel système d'exploitation s'agit-il? La réponse peut dépendre du système d'exploitation impliqué. Cependant, il semble que vous deviez trouver cette bibliothèque BLAS et l'installer. Il ne semble pas être dans PIP (vous devrez donc le faire à la main), mais si vous l'installez, cela devrait vous permettre de progresser dans l'installation de SciPy.

dans mon cas, la mise à niveau de pip a fait l'affaire. De plus, j'ai installé scipy avec le paramètre -U (mettez à niveau tous les packages vers la dernière version disponible)