Essentiellement, pour les débutants, le substrat est purement esthétique. Les objectifs de filtration obtenus à partir d'un lit de sable profond ou de tout autre rocher utilisé comme substrat ne sont pas des impératifs pour le bien-être de la plupart des aquariums. De plus, les débutants ne s’occuperont généralement pas d’animaux ou de plantes qui dépendent d’un type de substrat spécifique.
En ce qui concerne les détenteurs plus avancés, ou les détenteurs d'organismes qui dépendent du substrat, le manque d'un substrat peut entraîner la chute d'un écosystème aquatique. Certains animaux sont particulièrement dépendants du fouissage du sable et leur bien-être peut dépendre de cette habitude. La première chose qui vous dit si l’organisme est dépendant du substrat est si elle a évolué d’une manière ou d’une autre afin de se maintenir avec le substrat de façon appropriée. Certains organismes peuvent simplement tirer parti d'un substrat dans son environnement, mais cela ne signifie pas que toute cette espèce a besoin du substrat, car il peut varier selon les endroits géographiques où cette espèce s'est étendue. Le substrat peut altérer la chimie de l'eau, en l'adoucissant ou en le durcissant, et en modifiant le pH. Bien que le substrat puisse avoir une contribution perceptible à la filtration biologique, cela peut être compensé dans le filtre lui-même. En outre, le substrat peut être important pour l'hibernation, de nombreux animaux tels que les grenouilles et les tortues creuseront dans le substrat sous l'eau et hiberneront par temps très froid. Les propriétaires d'étangs de plein air dans les pays où les hivers sont froids doivent fournir aux habitants de leur étang un substrat adapté à leurs besoins d'hibernation.
Essentiellement, il vous suffit de préciser le substrat lorsque les habitants de votre réservoir en dépendent. Il convient de noter cependant que même les organismes qui ne dépendent pas d'un substrat peuvent préférer un substrat.