Comment pixelliser SpatialPolygons dans R?

J'essaie d'extraire les valeurs bathymétriques de ma zone d'intérêt d'une couche raster bathymétrique mondiale en utilisant la fonction 'rasterize' dans le package {sp}.

* Modifications: j'ai trouvé la fonction «extraire» qui semble être plus ce que je recherche.

Voici ce que j'ai fait jusqu'à présent:

> class(subarea0) #This is my area of interest (Eastern Canadian Arctic Sea)
[1] "SpatialPolygons"
attr(,"package")
[1] "sp"

> extent(subarea0)
class       : Extent 
xmin        : -82.21997 
xmax        : -57.21667 
ymin        : 60.2 
ymax        : 78.16666

library(marelac)
data("Bathymetry")#World bathymetric data in library (marelac)
names(Bathymetry);class(Bathymetry);str(Bathymetry)
[1] "x" "y" "z"
[1] "list"
List of 3
 $ x: num [1:359] -180 -179 -178 -177 -176 ...
 $ y: num [1:180] -89.5 -88.5 -87.5 -86.5 -85.5 ...
 $ z: num [1:359, 1:180] 2853 2873 2873 2873 2873 ...

  raster_bath<-raster(Bathymetry)#Transformed into a raster layer
    extent(raster_bath) <- extent(subarea0)#Transform the extend of my raster to the extend of my SpatialPolygons

>ras_sub0<-rasterize(subarea0,raster_bath)#rasterize my SpatialPolygons (*Edits: not the function that I need here, but I am still interested to learn what results mean)
Found 2 region(s) and 10 polygon(s)
> plot(ras_sub0)
> plot(subarea0, add=TRUE)

> ras_sub0
class       : RasterLayer 
dimensions  : 180, 359, 64620  (nrow, ncol, ncell)
resolution  : 0.06964709, 0.0998148  (x, y)
extent      : -82.21997, -57.21667, 60.2, 78.16666  (xmin, xmax, ymin, ymax)
coord. ref. : +proj=longlat +ellps=WGS84 
values      : in memory
min value   : 1 
max value   : 2 
layer name  : layer 

Je ne comprends pas le résultat. Pourquoi est-ce que j'obtiens 2 couleurs pour chacun de mes polygones? Que signifient-ils?

Comment puis-je finalement obtenir le contour de profondeur bathymétrique? Est-ce lié à ma résolution ou à la modification des dimensions?

* Modifications: ok, j'ai maintenant fait ce qui suit:

v <- extract(raster_bath, subarea0)#Extract data from my Raster Layer for the locations of my SpatialPolygons

v est une liste et je ne sais pas trop comment / sous quelle forme pour relier cette information avec mon polygone spatial ...

Je vous remercie!

Votre ligne ras_sub0<-rasterize(subarea0,raster_bath)prend simplement le numéro d'index des polygones et l'affecte aux valeurs du raster.

Si vous voulez juste l'intersection de votre polygone et du raster:

subarea0_bathy <- intersect(raster_bath, subarea0)

Mise à jour : Comme le note @GodinA, il semble que intersect () ne renvoie parfois pas un raster qui a l'étendue complète du polygone! Pour contourner ce problème, vous pouvez croiser un raster légèrement plus grand que votre original:

r2 <- raster() # create a generic raster
extent(r2) <- extent(subarea0) + 1 # add 1 degree of extent (0.5 each side)
r3 <- intersect(raster_bath, r2) 

Voici une autre solution, en utilisant une fonction de sous-ensemble de base dans raster.

# create a raster with the dimensions that you are interested in.
r <- raster(extent(subarea0)+1) # +1 to increase the area
res(r) <- 0.1 # you can change the resolution here. 0.1 can be about 10x10 km if you are close to the equator.
crs(r) <- projection(subarea0) # transfer the coordinate system to the raster

# Now you can add data to the cells in your raster to mark the ones that fall within your polygon.
r[subarea0,] <- 1 # this an easy way to subset a raster using a SpatialPolygons object

# check your raster
plot(r)